但是，目前它的使用率还没有达到令人满意的程度，想要让它得到进一步的发展，虽然硅藻土污水处理剂在废水处理上已得到一定的应用，而且效果也比较好，但是通过外相比，它还存在着一些不足之处，现在就来有哪些不足之处，以及怎样解决这个问题。
　　先解决原料问题。它所使用的原料硅藻土，在国内的产量虽然较多，但是直接开采出来的并不能够满足加工的需要，它的运用范围还不是特别广，现在主要运用的只有几种类型。所以在日后，要加强对处理的机理还有处理的规律，以及处理效果的影响因素的研究，扩大它的使用范围。因为它的性能比较差，而加工需要好的原料。所以在开采后要先对原料进行处理，提高质量，达到加工的标准。
　　其次，解决回收问题。在国外，会在硅藻土助滤剂使用后进行回收和再利用，这样，不仅节约了能源，降低了成本，而且也不会带来污染。要加强对硅藻土污水处理剂的性质，性能还有使用效果的研究，是它能够紧随大众需求的步伐。但是在国内，目前，还没有好的回收和循环利用的能力，所以一定要加强这方面的研究，提高回收的能力。
　　然后，解决产量问题。由于生产硅藻土助滤剂的工艺比较复杂，资源也比较少而且价格比较高，所以生产的成本也比较高。但这产量不高，无法大规模供给，所以在日后，要加强对处理的机理还有处理的规律，以及处理效果的影响因素的研究，扩大它的使用范围。