氢气发生器属于电解制氢原理，但其区别在于核心部件电解槽的类型。电解槽电解出氢气后，需要进行纯化才能供仪器使用。常见的纯化方式主要有以下几种：
一：硅胶/分子筛除湿除杂系统
硅胶和分子筛除湿除杂系统是常用的氢气发生器净化装置。通常情况下，硅胶用于初步脱水，分子筛用于进一步除湿除杂，进行二级纯化。硅胶价格便宜，活化再生方便，因此被广泛使用。
需要注意的是，硅胶吸附水分后，颜色会从天蓝色变为粉红色，需及时更换。
二：变压吸附净化系统
变压吸附(PSA)是一种用于气体分离的技术。其基本原理是根据不同压力下吸附剂对不同物质的吸附容量不同，从而实现气体分离。在高压下，吸附剂吸附气体中的杂质，让氢气通过吸附层变得更少，并成为所需的产品气；然后在低压下，被吸附的杂质气解吸出来。这一过程循环往复，最终得到足量的氢气。
三：钯薄膜净化系统
除了上述两种纯化方式，一些仪器厂家提供了采用钯薄膜的净化系统。该系统利用高温下只有氢原子才能穿透钯银合金薄膜的特性进行净化。当氢原子穿透钯银合金薄膜后，在另一侧的钯薄膜上，单原子氢重新组合为双原子氢气。据相关厂家说明，此方法可产生纯度超高的氢气，几乎无水分或氧气携带，纯度超过99.99999%。
综合比较，硅胶/分子筛净化系统可以满足便携式FID/气相色谱等常规分析纯度的要求，与其他提纯方法相比性价比更高。