银杏各器官含有不同量的水分。根、茎、枝、叶含水量50%左右，果实含水量约80%。银杏的生命活动是以水为介质的，水分能使树体各部分保持膨胀和新鲜状态。所以，水分在银杏的生命活动中是不可缺少的生态因子。

银杏的根系比较发达，依靠根压吸水供给树体各个部分的需要，银杏叶片的蒸腾作用，形成蒸腾拉力，这种拉力成为根系吸取水分的主要动力。银杏根部的吸水量与土壤持水量有关，土壤持水在水分当量至饱合的范围内，土壤持水量越高，吸水越容易。水分经过输导组织，送到树体各器官，保持了水分平衡，土壤持水量在水分当量以下时，会出现蒸腾大于吸收，树体枝叶萎蔫下垂，气孔变小，蒸腾减弱，以求水分平衡暂时恢复。所以银杏树体的水分是经常处于动态平衡之中， 这是由银杏的调结机制和诸多环境因子相互作用的结果。银杏枝繁叶茂，根系发达，从根部吸收的水分通过叶片的蒸腾作用到大气中，只有2－3%的水分用于合成碳水化合物。

银杏抗旱能力较强。在年降水量1000毫米左右的地区，成年及古老树一般都不需灌溉，作为商品经营的果园，在生长发育主要时期仍应适当浇水。根据年周期内的物候现象，如早春干旱，树液流动，，萌芽开始，要及时春灌，否则 将出现生理干旱而“抽条”。花期缺水，容易落花，影响传粉授精，需要在开花前结合追肥浇水。果实迅速发育期，需水量更大，如果供水不足，会降低品质和产量。幼果发育常和枝叶旺盛生长同步，适时灌溉，达到枝繁叶茂，枝条充分成熟，可以提高越冬性。 

同时，在雨季要特别注意排水防涝，并要挖好排水沟。