RIP-seq—RNA-蛋白质相互作用研究技术
抗体类型丰富:
具有多种商品化抗体,高效支持实验开展。应用方向
信息分析
RIP-seq测序项目,通过对IP下来的合格RNA样本,建库测序,获得高质量reads,进行peak calling,对peak相关基因进行功能富集分析。分析内容 | 解决问题 |
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测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
与参考基因组比对 | 唯一比对的 reads 分布统计 |
peak峰calling | 分析蛋白结合位点 |
样品间相关性分析 | 判断实验分组设计是否合理 |
motif分析 | 蛋白结合序列的偏好性 |
peak峰相关基因注释 | 寻找蛋白潜在调控或者结合的基因 |
差异peak分析 | 分析不同样本间差异peak峰 |
相关基因功能分析 | 相关基因GO,KEGG富集分析 |
关联分析
基于文章高频出现的RIP-seq与RNA-seq关联分析内容,搭建了关联分析流程,助力高分文章发表。RIP-seq与RNA-seq关联分析 | 1. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因维恩图 |
2. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因分析GO 富集分析 | |
3. 差异peak相关基因与mRNA差异基因交集基因分析KEGG 富集分析 |